Bazen bağışıklık sisteminiz aldanır. Bir grup bakteri veya virüs vücudunuzdaki bazı hücrelere (mesela kalp hücreleri) çok benzer davranır.
Bağışıklık sisteminiz bu bakteri veya virüsleri yok edebilir ama bu sırada yanlışlıkla çok değerli ve vücudumuz için gerekli gerçek kalp hücrelerine de saldırıp zarar vermeye başlar.
Burada kalp hücreleri sadece örnek olarak gösterilmiştir.
Birçok organ veya doku kendilerini koruması için oluşmuş bağışıklık sistemi saldırısına karşı savunmasızdır. Bağışıklık sistemi hastalıklarının bazıları, cilt veremi, huzursuz (iltihaplı) bağırsak sendromu ve ramotoid artrit (eklem romatizması) olarak sayılabilir.